Только за первый год после выхода картины на экраны в СССР её посмотрели почти 70 миллионов кинозрителей, или 31% населения страны! Это сделало картину лидером советского кинопроката 1965 года.
Однако, каких-либо фестивальных достижений фильм Леонида Гайдая не снискал. Разве что премия "Серебряный Дракон", которую присвоили новелле "Наваждение" на не самом известном Краковском международном кинофестивале, специализирующемся на короткометражных фильмах. И эта премия имеет своё объяснение: сюжет новеллы "Наваждение" взят Леонидом Гайдаем из польского журнала "Шпильки". Но у себя на родине фильм не получил никаких официальных наград. Более того, факт награждения фильма на Краковском кинофестивале не нашёл отражения ни в русской Википедии, ни на сайте Кинопоиска.
Да и путь картины к отечественному зрителю был довольно тернист. Известный историк советского кинематографа Федор Раззаков приводит такие факты из истории фильма: "23 апреля состоялся просмотр фильма худсоветом, на котором Иван Пырьев, в частности, потребовал «кончать снимать Моргунова и Пуговкина. Они не интересны и надоели...». После чего другая инстанция – сценарно-редакционная коллегия – потребовала от Гайдая вырезать ряд эпизодов, в частности, когда «негр» Верзила гоняется за Шуриком и когда студенты сдают экзамены. Но Гайдай оставил все как есть. Чуть позже ему это припомнили, когда присваивали категорию фильму. 2 июля комиссия по определению группы отнесла «Операцию «Ы» ко 2-й категории. Для примера заметим, что в том же году к 1-й категории причислили фильмы «Мы, русский народ» (за шесть месяцев фильм собрал 4 млн. зрителей), «Я вижу солнце» (5,1 млн. за шесть месяцев), «Кто оседлает коня» (6,6 млн. за шесть месяцев), которые сегодня мало кто помнит." Но, справедливости ради, надо признать, что после долгих препирательств фильму всё-таки присвоили 1-ю категорию, и он был выпущен весьма крупным тиражом - 1197 копий. И в итоге принёс колоссальный доход в бюджет государства.
Российский кинокритик Евгений Нефёдов в 2014 году так написал об этом фильме: "Причины триумфа «Операции «Ы» и других приключений Шурика» в кинопрокате не нуждаются в пояснении любому, кто достаточно долго прожил в СССР (или, как минимум, получил адекватные представления о славном периоде отечественной истории), но ведь лента остаётся вечнозелёной, не утрачивая актуальности, с лёгкостью покоряя всё новые поколения зрителей. Среди сравнительно недавних красноречивых примеров – выдвижение в 2009-м году музыкальным телеканалом «MTV Россия» на кинопремию в номинации «Лучший советский фильм». (Дело ограничилось только номинацией. Лучшим советским фильмом была признана картина Владимира Меньшова "Москва слезам не верит". Но попасть в пятёрку лучших - тоже многое значит.)
Об актуальности, или, по словам Евгения Нефёдова, "вечнозелёности" картины Гайдая свидетельствуют её рейтинги на сайтах IMDB и Кинопоиска. 84% пользователей этих сайтов поставили фильму "Операция "Ы" и другие приключения Шурика" оценки от 8 до 10. А 43% пользователей оценили фильм высшим баллом - "десяткой. С учетом сказанного, рейтинг фильма Леонида Гайдая "Операция "Ы" и другие приключения Шурика" составил 8,701, что позволило этой картине занять 246-е место в Золотой Тысяче.